绍兴市上虞第二人民医院外科在医院成立之日已创建，为医院重要科室，经过外科医生的代代相传，目前五病区外科有主任医师4名，副主任医师1名，主治医师2名，住院医师2名，分设泌尿外科、肝胆胃肠外科、肛肠外科、胸外科、甲状腺疝外科等亚专科，开放床位57张。科室医疗设备先进，拥有先进的超声刀、腹腔镜、膀胱镜、输尿管软镜、输尿管硬镜、肾镜、钬激光、胸腔镜、胆道镜等设备。目前科室常规开展食管癌根治术，肺癌根治术，甲状腺癌根治术，颈淋巴结清扫术，胃癌根治术，胰腺十二指肠切除术，胆肠吻合术，结直肠癌根治术，痔上粘膜环切术等外科手术。泌尿外科微创手术如前列腺电切术、输尿管结石钬激光碎石术、经皮肾镜激光碎石取石术、腹腔镜下前列腺癌根治术、腹腔镜下肾上腺切除术、腹腔镜下肾部分切除术等广泛开展。在泌尿系结石、前列腺增生、胃肠道肿瘤、甲状腺肿瘤、胆道结石、腹腔镜手术、外科重症及急腹症的诊治方面积累了一定的经验。同时在微创外科手术方面取得了长足进展，顺利开展腹腔镜下胆囊切除术、阑尾切除术、经腹腹膜前腹股沟疝修补术等腹腔镜常规手术。